מידי שנה מתפרסמים קריטריונים למתן תמיכה כספית לעמותות, בהתאם להחלטת הממשלה אשר קובעת לאלו נושאים תוענק תמיכה ממשלתית באותה שנת תקציב.
כל משרד שמתקצב מפרסם מדי שנה, בסמוך למועד הגשת הבקשה, את תנאי הסף עליהם ייבחן המוסד לצורך קבלת הזכאות ואת אופן חלוקת הכספים.
הגשת בקשת תמיכה מבוצעת באופן מקוון באתר משרד הממשלה המתאים. מדובר בתהליך הדורש זמן וידע פיננסי לצורך מילוי טפסים ודיווחים כספיים שונים.