חשבות שכר מהווה מרכיב מהותי כאשר ביצוע יעיל ומדויק חשובים ביותר להתנהלות נכונה ומוצלחת של העמותה.
חשבות שכר והפקת משכורות הינם תחומים מרכזיים ואף קריטיים לניהולה השוטף של עמותה. בראש ובראשונה, החשיבות טמונה בעובדה ששכר הינו רכיב משמעותי ביותר בהוצאות. לכן, ניהולן התקין והנכון של משכורות חיוני להמשכיות קיומה של העמותה, גדילתה וצמיחתה.
לעיתים המורכבות של הפקת משכורות נובעת בין היתר משינויים שחלו במשק המקומי, ובסעיפי הוצאות רבים, בחוזי העסקה אישיים שהובילו לתוספות והתאמות שונות שיש לכלול בחישוב השכר. התוספות וההתאמות כוללות בין היתר קרנות השתלמות, פנסיה, ביטוחי מנהלים, הוצאות אחזקת רכב, ועוד נתונים המשתנים בהתאם לחקיקה מעת לעת.